More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3631 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  74.52 
 
 
520 aa  783    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  72.62 
 
 
533 aa  743    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4223  GMP synthase  71.1 
 
 
517 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655069  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1733  GMP synthase, large subunit  69.88 
 
 
535 aa  719    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.699904  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  72.54 
 
 
533 aa  757    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  72.47 
 
 
547 aa  751    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  74.62 
 
 
528 aa  776    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0910  GMP synthase, large subunit  70.46 
 
 
519 aa  739    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  71.81 
 
 
519 aa  739    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  73.75 
 
 
515 aa  759    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  71.24 
 
 
526 aa  746    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  71.15 
 
 
539 aa  721    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  75.14 
 
 
519 aa  774    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  70.97 
 
 
524 aa  744    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  74.76 
 
 
523 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  62.5 
 
 
516 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  68.44 
 
 
556 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  68.88 
 
 
516 aa  737    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  75.24 
 
 
527 aa  782    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  69.75 
 
 
529 aa  726    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4903  GMP synthase  71.62 
 
 
522 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.137023  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  73.36 
 
 
534 aa  761    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  71.81 
 
 
519 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3833  GMP synthase  71.46 
 
 
517 aa  732    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.587274  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  68.73 
 
 
520 aa  726    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  70.21 
 
 
523 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  69.94 
 
 
529 aa  729    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1506  GMP synthase  72.16 
 
 
523 aa  754    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  70.06 
 
 
534 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  71.24 
 
 
522 aa  717    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  100 
 
 
527 aa  1059    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  71.81 
 
 
519 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  74.76 
 
 
517 aa  774    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  72.78 
 
 
522 aa  751    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  67.57 
 
 
520 aa  720    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  69.81 
 
 
527 aa  724    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  70.41 
 
 
525 aa  739    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  75 
 
 
526 aa  786    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04770  GMP synthase  74.52 
 
 
514 aa  762    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  59.73 
 
 
533 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  60.89 
 
 
506 aa  618  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  58.73 
 
 
510 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  56.7 
 
 
510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  56.7 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  56.98 
 
 
513 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  55.83 
 
 
511 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  57.69 
 
 
513 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  53.64 
 
 
512 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  53.9 
 
 
515 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  54.1 
 
 
515 aa  594  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  53.9 
 
 
515 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  53.83 
 
 
512 aa  594  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  53.9 
 
 
512 aa  592  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  53.9 
 
 
512 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  53.45 
 
 
512 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  53.71 
 
 
512 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  53.45 
 
 
512 aa  589  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  53.71 
 
 
515 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  55.38 
 
 
509 aa  590  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  54.21 
 
 
512 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  55.38 
 
 
509 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  57.6 
 
 
517 aa  581  1e-164  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  53.15 
 
 
511 aa  578  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  52.37 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  52.37 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  53.92 
 
 
511 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  52.18 
 
 
513 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  54.32 
 
 
560 aa  570  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  54.21 
 
 
511 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  53.37 
 
 
508 aa  570  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.88 
 
 
510 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  54.33 
 
 
528 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  53.93 
 
 
537 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.85 
 
 
510 aa  567  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  53.89 
 
 
575 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  57.97 
 
 
510 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.93 
 
 
533 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  53.96 
 
 
540 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  54.36 
 
 
575 aa  561  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  53.26 
 
 
510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  53.93 
 
 
560 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  51.63 
 
 
514 aa  558  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  52.49 
 
 
512 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  53.03 
 
 
516 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  52.71 
 
 
542 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  51.42 
 
 
517 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  52.02 
 
 
520 aa  558  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  52.71 
 
 
542 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  52.02 
 
 
517 aa  557  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  56.21 
 
 
512 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  52.79 
 
 
517 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  52.56 
 
 
540 aa  551  1e-156  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  53.13 
 
 
542 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  53.78 
 
 
528 aa  555  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  54.32 
 
 
509 aa  554  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  52.84 
 
 
516 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  53.03 
 
 
516 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  54.38 
 
 
528 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  51.35 
 
 
513 aa  553  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  55.83 
 
 
512 aa  554  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>