More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0378 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  71.08 
 
 		 523 aa  790    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  68.65 
 
 		 520 aa  720    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  71.15 
 
 		 520 aa  784    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  71.15 
 
 		 520 aa  785    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  72.12 
 
 		 520 aa  783    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  81.65 
 
 		 533 aa  889    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  74.66 
 
 		 565 aa  807    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  70.5 
 
 		 528 aa  722    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  75.24 
 
 		 535 aa  808    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  69.08 
 
 		 518 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  100 
 
 		 534 aa  1079    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  73.51 
 
 		 530 aa  780    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  75.24 
 
 		 534 aa  806    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  69.39 
 
 		 518 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  73.08 
 
 		 520 aa  790    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  68.97 
 
 		 520 aa  723    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  69.32 
 
 		 525 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  68.33 
 
 		 541 aa  721    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  75.05 
 
 		 540 aa  802    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  70.8 
 
 		 540 aa  756    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  75.24 
 
 		 524 aa  796    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  66.79 
 
 		 535 aa  690    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  77.54 
 
 		 518 aa  802    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  76.01 
 
 		 535 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  75.24 
 
 		 556 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  69.27 
 
 		 518 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  75.82 
 
 		 540 aa  817    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  71.92 
 
 		 518 aa  767    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  67.62 
 
 		 520 aa  711    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  69.22 
 
 		 537 aa  729    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  70.17 
 
 		 526 aa  757    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  74.04 
 
 		 519 aa  791    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  76.05 
 
 		 521 aa  804    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  72.69 
 
 		 520 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  76.05 
 
 		 521 aa  803    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  73.46 
 
 		 520 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  70.34 
 
 		 519 aa  749    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  76.78 
 
 		 521 aa  809    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  78.69 
 
 		 518 aa  814    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  77.16 
 
 		 518 aa  813    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  60.31 
 
 		 517 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  69.2 
 
 		 519 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  60.46 
 
 		 516 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  60.46 
 
 		 516 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  60.84 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  60.84 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  59.81 
 
 		 516 aa  623  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  60.58 
 
 		 518 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  61.35 
 
 		 518 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  58.43 
 
 		 518 aa  609  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  60.77 
 
 		 518 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  60.77 
 
 		 518 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  58.06 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  58.27 
 
 		 515 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  55.96 
 
 		 514 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  57.01 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  56.27 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  57.03 
 
 		 515 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  56.65 
 
 		 515 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  56.24 
 
 		 515 aa  579  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  57.77 
 
 		 520 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  55.51 
 
 		 532 aa  579  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  56.18 
 
 		 509 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  54.67 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  58.16 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  55.89 
 
 		 521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  53.69 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  53.69 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  57.39 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  54.14 
 
 		 517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  53.82 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  55.81 
 
 		 527 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  54.36 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  54.87 
 
 		 527 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  55.05 
 
 		 516 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  53.69 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  55.81 
 
 		 527 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  57.97 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  55.98 
 
 		 513 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  53.32 
 
 		 525 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  54.2 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2337  GMP synthase  54.01 
 
 		 544 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  57.34 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  53.95 
 
 		 526 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  53.5 
 
 		 525 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.88 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  56.73 
 
 		 520 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  54.01 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>