More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1375 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  70.35 
 
 		 521 aa  740    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1587  GMP synthase  85.38 
 
 		 520 aa  924    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0923509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1321  GMP synthase  65.76 
 
 		 530 aa  709    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.485568 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  68.77 
 
 		 520 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  64.95 
 
 		 528 aa  692    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  70.27 
 
 		 518 aa  744    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  65.19 
 
 		 518 aa  710    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  70.55 
 
 		 520 aa  758    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  70.16 
 
 		 521 aa  740    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  69.41 
 
 		 520 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  63.88 
 
 		 520 aa  679    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  67.57 
 
 		 535 aa  725    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  69.16 
 
 		 523 aa  741    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  67.83 
 
 		 565 aa  724    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  84.14 
 
 		 518 aa  909    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  67.37 
 
 		 526 aa  712    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  84.14 
 
 		 518 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3696  GMP synthase  80.73 
 
 		 519 aa  873    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  69.96 
 
 		 534 aa  748    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0355  GMP synthase  66.09 
 
 		 525 aa  702    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  67.44 
 
 		 540 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  66.03 
 
 		 540 aa  715    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2221  GMP synthase  84.81 
 
 		 535 aa  906    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  70.16 
 
 		 518 aa  738    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  70.16 
 
 		 521 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  66.6 
 
 		 535 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  67.64 
 
 		 556 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  66.54 
 
 		 540 aa  715    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  65.45 
 
 		 533 aa  690    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1375  GMP synthase  100 
 
 		 520 aa  1075    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.497878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0634  GMP synthase  64.94 
 
 		 537 aa  694    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.324774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  70.17 
 
 		 520 aa  750    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  68.58 
 
 		 519 aa  726    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3211  GMP synthase  63.76 
 
 		 541 aa  682    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.689429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  69.77 
 
 		 518 aa  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  67.62 
 
 		 534 aa  711    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  69.02 
 
 		 520 aa  745    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  65.31 
 
 		 519 aa  705    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  68.01 
 
 		 524 aa  728    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  84.33 
 
 		 518 aa  911    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  68.58 
 
 		 520 aa  738    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  57.88 
 
 		 516 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  57.69 
 
 		 517 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  57.47 
 
 		 516 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  57.66 
 
 		 516 aa  610  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  57.53 
 
 		 518 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  57.55 
 
 		 527 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  57.55 
 
 		 527 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  56.13 
 
 		 520 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  55.96 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  55.99 
 
 		 527 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  57.17 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  57.17 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  57.61 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  56.84 
 
 		 521 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  55.03 
 
 		 522 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  54.56 
 
 		 514 aa  586  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  55.19 
 
 		 520 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  55.17 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  54.75 
 
 		 522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  56.67 
 
 		 540 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1287  GMP synthase  55.82 
 
 		 539 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0197854  normal  0.456639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  56.01 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.43 
 
 		 511 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  56.22 
 
 		 538 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  56.22 
 
 		 538 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  53.92 
 
 		 513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1431  GMP synthase  54.81 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00571837  normal  0.0960661 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1292  GMP synthase  56.27 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1522  GMP synthase  56.27 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.403543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  54.86 
 
 		 520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2546  GMP synthase  56.09 
 
 		 547 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2021  GMP synthase  56.27 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2058  GMP synthase  55.82 
 
 		 599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2454  GMP synthase  56.27 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3290  GMP synthase  56.27 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0624455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  56.41 
 
 		 525 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2402  GMP synthase  56.27 
 
 		 539 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.630699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  54.84 
 
 		 524 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  54.1 
 
 		 540 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  55.03 
 
 		 526 aa  569  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  54.18 
 
 		 539 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  56.51 
 
 		 518 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  55.32 
 
 		 515 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0530  GMP synthase  55.33 
 
 		 535 aa  567  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1891  GMP synthase  55.45 
 
 		 539 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.888833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1622  GMP synthase  54.95 
 
 		 534 aa  568  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661733  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5299  GMP synthase  55.27 
 
 		 539 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  53.41 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  57.09 
 
 		 518 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2063  GMP synthase, large subunit  55.43 
 
 		 532 aa  568  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0340406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  54.6 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2022  GMP synthase  55.45 
 
 		 539 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  53.86 
 
 		 525 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  54.58 
 
 		 517 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.61 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2009  GMP synthase  54.9 
 
 		 539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  56.32 
 
 		 518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  54.58 
 
 		 533 aa  562  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1989  GMP synthase  54.9 
 
 		 539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>