More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  100 
 
 
247 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  37.18 
 
 
232 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.24 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.52 
 
 
223 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  35.5 
 
 
219 aa  129  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.11 
 
 
228 aa  125  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.29 
 
 
238 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.23 
 
 
226 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.38 
 
 
217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  36.64 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  37.45 
 
 
225 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  37.45 
 
 
225 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  37.45 
 
 
225 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  35.5 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  33.91 
 
 
231 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.54 
 
 
231 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  32.23 
 
 
214 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.38 
 
 
235 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
228 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  31.34 
 
 
216 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
224 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.07 
 
 
232 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
237 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  30.64 
 
 
216 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.02 
 
 
217 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  31.11 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.59 
 
 
228 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  31.11 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  34.19 
 
 
228 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  30.88 
 
 
224 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  31.2 
 
 
215 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  30.23 
 
 
216 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.56 
 
 
222 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.46 
 
 
221 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  30.04 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.47 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  36.25 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.72 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  28.76 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.82 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.99 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  27.16 
 
 
221 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.65 
 
 
236 aa  89  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.16 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  31.36 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  28.63 
 
 
218 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  26.72 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  26.72 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  26.72 
 
 
221 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  30.18 
 
 
234 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  25.86 
 
 
221 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.84 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.83 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.86 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  29.82 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  31.42 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  26.87 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  26.87 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  31.33 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.69 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  31.91 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.68 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.49 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.83 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  29.6 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.99 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.17 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.17 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.74 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.87 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  27.92 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  29.07 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  31.53 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  30.04 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  30.04 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  24.64 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  27.2 
 
 
461 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  25.27 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  30.51 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  28.38 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  27.66 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.39 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>