More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2228 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  100 
 
 
212 aa  425  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  79.9 
 
 
211 aa  346  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  57.55 
 
 
219 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  57.55 
 
 
219 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  57.35 
 
 
222 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  38.16 
 
 
273 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  38.24 
 
 
214 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.89 
 
 
211 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.89 
 
 
211 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.89 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  34.93 
 
 
211 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  34.45 
 
 
211 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  34.45 
 
 
213 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 
213 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 
213 aa  141  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.45 
 
 
211 aa  141  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
218 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.96 
 
 
238 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.69 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  30.69 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  28.02 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  33.33 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  29.47 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  28.22 
 
 
224 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.31 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
216 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  31.75 
 
 
214 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  31.75 
 
 
207 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  30.69 
 
 
211 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
243 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.1 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  26.46 
 
 
247 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  27.35 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  27.54 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  28.7 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  25.59 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  26.43 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  26.55 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.04 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.01 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  28.82 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  22.06 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  23.15 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  23.15 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.81 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  22.33 
 
 
233 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  27.06 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.79 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  23.15 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  24.73 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  25.78 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  23.29 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  25 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  22.73 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  24.11 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  24.22 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  24.73 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  24.43 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  24.29 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  22.07 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  24.42 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  22.11 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.71 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  22.83 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  22.9 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.62 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  24.12 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  23.88 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  23.88 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  25.26 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  24.87 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  24.55 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  26.53 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  24.56 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  23.04 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  23.42 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  21.92 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  30.23 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  23.42 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  24.67 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.24 
 
 
296 aa  65.1  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>