More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0841 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
207 aa  410  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  92.75 
 
 
207 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  92.75 
 
 
207 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  93.24 
 
 
211 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  88.89 
 
 
207 aa  339  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  88.41 
 
 
214 aa  337  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  82.61 
 
 
247 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  61.76 
 
 
240 aa  247  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  56.86 
 
 
205 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.62 
 
 
238 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.16 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  51.08 
 
 
222 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  50.27 
 
 
223 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  48.15 
 
 
225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  39.41 
 
 
219 aa  151  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.27 
 
 
232 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 
218 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  37.57 
 
 
210 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  36.1 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  44.62 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  30.65 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  35.96 
 
 
207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.65 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.18 
 
 
211 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  30.65 
 
 
211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.65 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 
213 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.61 
 
 
222 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  30.65 
 
 
213 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.11 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.75 
 
 
219 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.75 
 
 
219 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  29.33 
 
 
211 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  29.1 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  25.68 
 
 
214 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  31.53 
 
 
273 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.98 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  32.66 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.89 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
228 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.38 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  29.85 
 
 
218 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  30.41 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.57 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.27 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  30.63 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.55 
 
 
226 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.51 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.35 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 
225 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  26.57 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
228 aa  58.2  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  29.06 
 
 
461 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 
233 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  24.15 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.08 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  25.63 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.72 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  25.93 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.72 
 
 
218 aa  55.5  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.19 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 
234 aa  55.1  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.92 
 
 
217 aa  55.1  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.17 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.94 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.44 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  29.8 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  27.81 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.36 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  26.96 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  24.87 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.27 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  28.65 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.27 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.09 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.72 
 
 
233 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.29 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  28.08 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>