More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4242 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  98.07 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  87.92 
 
 		 207 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  87.92 
 
 		 207 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  88.41 
 
 		 207 aa  337  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  88.41 
 
 		 211 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  80.38 
 
 		 247 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  62.25 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  56.86 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.21 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  39.78 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.23 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  49.74 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.47 
 
 		 222 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  41.06 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  47.59 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.13 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  39.41 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.77 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.77 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  35.96 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  32.21 
 
 		 211 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  44.62 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.12 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.18 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.18 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.65 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.18 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  24.59 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  32.51 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.71 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.85 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.3 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  27.59 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  30.37 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.9 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  26.96 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.94 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.59 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  32.13 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.32 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  25.76 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.7 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.28 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.74 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  27.27 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.44 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.19 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.31 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.94 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.47 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.26 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.35 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  24.31 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  27.81 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.17 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.62 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.36 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>