More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3973 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  100 
 
 		 243 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  62.69 
 
 		 238 aa  254  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  64.65 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  58.85 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  60 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.24 
 
 		 216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  57.56 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  47.32 
 
 		 219 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  48.57 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  45.23 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  41 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  47.83 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  42.71 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.09 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  44.09 
 
 		 207 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  37.56 
 
 		 207 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  45.16 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.62 
 
 		 207 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  44.62 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  46.2 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  44.09 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.92 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.92 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  28.92 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  28.92 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.92 
 
 		 211 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.92 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.18 
 
 		 219 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.18 
 
 		 219 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  30.97 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.02 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.73 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.72 
 
 		 223 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  30.59 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  31.53 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  26 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  24.55 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.13 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.13 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  24.09 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  24.87 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.13 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  27.93 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  26.75 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.85 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.22 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  28.17 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.54 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  24.2 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.58 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.84 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  27.59 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  28 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  26.2 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  24.44 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>