More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6360 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  75.69 
 
 		 225 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  62.69 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  60.77 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  60.19 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  62.02 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.54 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  44.93 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  49.29 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  47.32 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  43.84 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  45.19 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.94 
 
 		 207 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  48.94 
 
 		 207 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  43.78 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  49.74 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  49.21 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.62 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  48.94 
 
 		 211 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  41.29 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  45.7 
 
 		 247 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  32.84 
 
 		 211 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  32.34 
 
 		 211 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  32.34 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.34 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.84 
 
 		 211 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.84 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  125  8.000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.41 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.41 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  30.96 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.34 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  29.21 
 
 		 273 aa  95.5  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  28.93 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  27.6 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 		 218 aa  62  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  32.75 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.82 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  25.47 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  26.03 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  26.96 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  30 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  24.07 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  30 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  30 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.25 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.15 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.14 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  23.61 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  24.52 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0284  HAD family hydrolase  24.78 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.05 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.51 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.74 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  26.17 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  24.06 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  22.22 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.03 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  24.27 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  23.65 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>