286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1191 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  100 
 
 		 214 aa  428  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.1 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.82 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.82 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  36.76 
 
 		 211 aa  154  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  38.24 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.3 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.3 
 
 		 219 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  25.84 
 
 		 273 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  32.16 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.87 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.73 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  23.12 
 
 		 240 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  23.88 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.42 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.59 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  24.59 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  25.25 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  24.59 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.68 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  24.59 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  24.59 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  22.95 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24 
 
 		 330 aa  62  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.91 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  21.46 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0740  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.62 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.865984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  27.42 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.44 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  29.77 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  22.22 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  24.34 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  20.98 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  24.76 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.85 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  19.81 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  22.75 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  23.04 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  22.96 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  28.12 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  23.29 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  22.96 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  21.7 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  22.71 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.84 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  21.83 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  21.26 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0284  HAD family hydrolase  20.29 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.13 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  18.87 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  23.36 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  23.3 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  23.36 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  21.99 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.22 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  19.71 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  26.2 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  20.83 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  20.09 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.36 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  23.04 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  23.28 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  24.19 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0907  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.9 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464753  normal  0.0304334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  23.94 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2403  HAD family hydrolase  20.87 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000854479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  20.94 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  20.43 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  21.26 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.71 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  18.87 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.35 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.9 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0569787 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.32 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.66 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  22.71 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.6 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  19.32 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  17.45 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>