More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5852 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  100 
 
 		 225 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  75.69 
 
 		 238 aa  315  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  64.65 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  61.82 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  62.02 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  62.5 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.39 
 
 		 216 aa  201  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  46.12 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  49.51 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  45.37 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.4 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  48.4 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  46.73 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  49.74 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  49.74 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  45.69 
 
 		 205 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.15 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  47.92 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  45.92 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  36.1 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.9 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.9 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  28.08 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.08 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  28.08 
 
 		 211 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.08 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.94 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.59 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  30.46 
 
 		 211 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  25 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.61 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  34.34 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.49 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  29.73 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.49 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0284  HAD family hydrolase  22.97 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.83 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  32.82 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.4 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.24 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  32.21 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.77 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  28.36 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.86 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.28 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.46 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  30.63 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.04 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0993  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0989  HAD family hydrolase  30.29 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  22.02 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  27.14 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  26.7 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  31.19 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.77 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2191  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0671825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  30.88 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.05 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  38.83 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>