More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00363 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  62.56 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  58.33 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  58.33 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  57.84 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  58.33 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  56.86 
 
 		 214 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  58.38 
 
 		 247 aa  207  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  56.86 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.22 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  44.33 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  46.94 
 
 		 223 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.78 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.37 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  47.83 
 
 		 243 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  38.31 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  45.69 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  38.3 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.55 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.95 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.58 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.95 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  30.58 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  31.07 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.07 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  31.07 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 211 aa  118  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.24 
 
 		 222 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.58 
 
 		 211 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  33 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  30.58 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  30.58 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  23.88 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.51 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  30.29 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.5 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  29.74 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  29.05 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  32.18 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  32.12 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  28.83 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.96 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.12 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0153652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  24.32 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  24.32 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 461 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  30.69 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  27.8 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  30.93 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.52 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.16 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.27 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  30.2 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.11 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  27.51 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  29.56 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  28.44 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>