186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3729 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  100 
 
 
247 aa  486  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  84.54 
 
 
207 aa  340  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  84.54 
 
 
207 aa  340  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  85.02 
 
 
211 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  82.61 
 
 
207 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  80.38 
 
 
214 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  80.68 
 
 
207 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  59.8 
 
 
240 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  58.38 
 
 
205 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.7 
 
 
238 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.27 
 
 
216 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.89 
 
 
222 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  48.92 
 
 
223 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  45.92 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
210 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.68 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  37.44 
 
 
219 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  46.2 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.33 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.33 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  35.61 
 
 
224 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  37.68 
 
 
218 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  33.99 
 
 
207 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  30.17 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.17 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.17 
 
 
211 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  30.17 
 
 
213 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  29.86 
 
 
211 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  30.17 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.61 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.17 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  30.17 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  30.17 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
212 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  22.95 
 
 
214 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
273 aa  85.1  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  30 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.72 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.47 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  30.46 
 
 
461 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.06 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  29.21 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.17 
 
 
217 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.1 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.85 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  29.36 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.96 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  27.46 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.75 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
226 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
223 aa  52  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 
234 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 
231 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 
252 aa  52  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  23.76 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  30 
 
 
228 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  28.92 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.86 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  25.5 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.69 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  23.79 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 
233 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  26.47 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  31.79 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  25.37 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.05 
 
 
220 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 
252 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 
228 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 
252 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 
252 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  24.74 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  28.92 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  27.81 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.79 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>