More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5407 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  100 
 
 		 211 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  99.52 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  99.52 
 
 		 207 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  93.24 
 
 		 207 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  89.37 
 
 		 207 aa  339  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  88.41 
 
 		 214 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  85.02 
 
 		 247 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  63.24 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  58.33 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.94 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.53 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.2 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  48.92 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  47.92 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  38.92 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  37.91 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.92 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  39.61 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  36.1 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  36.95 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.25 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.25 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  44.09 
 
 		 243 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.65 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.18 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.72 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.18 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.18 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  31.18 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  30.69 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  29.81 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  24.59 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 		 273 aa  94.7  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.44 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.98 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  31 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  31.72 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  31.84 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.67 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  30.97 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.53 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.43 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.32 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.64 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.05 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  31.9 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  27.88 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.18 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0689  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.08 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  24.15 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  24.87 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  30 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.83 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  26.9 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.06 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  23.94 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.57 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.41 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.41 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.77 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  29.74 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>