More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2635 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2635  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6360  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.54 
 
 		 238 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2010  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.41 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3973  HAD family hydrolase  47.24 
 
 		 243 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2488  HAD family hydrolase  45.81 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  44.12 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5852  HAD family hydrolase  44.39 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2324  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.89 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2049  HAD family hydrolase  45.41 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.492195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0445  HAD family hydrolase  41.63 
 
 		 210 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000016642  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  40 
 
 		 205 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1057  HAD family hydrolase  41.58 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0433327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1098  HAD superfamily hydrolase  37.07 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3487  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.2 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00401487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4879  hydrolase  37.2 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0841  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.16 
 
 		 207 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4242  hydrolase  36.23 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5407  hydrolase  37.2 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4767  hydrolase  36.23 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8278  virP  36.14 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.68 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.68 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2262  HAD superfamily hydrolase  33.01 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0241329  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3729  hydrolase  36.27 
 
 		 247 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  33.01 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  33.01 
 
 		 213 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.41 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.01 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.95 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4032  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.95 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  32.8 
 
 		 211 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1191  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.36 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.77 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  28.65 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  24.65 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  25.37 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.88 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  23.35 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  24.67 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  24.22 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  24.88 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  24.41 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  23.61 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  24.38 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  25.25 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  24.04 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  23.26 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  24.61 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  24.29 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  25.32 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  23.15 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  23.91 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  22.22 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  22.82 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  25.66 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  22.33 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  24.24 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  25.46 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  24.4 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  25.33 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0608  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.91 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.17264e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  26.09 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.63 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  26.13 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.29 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  23.65 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  24.23 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  24.31 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  24.35 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.5 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  24.65 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  21.78 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  24.86 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.4 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  25.44 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  25 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>