16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1789 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 227 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  50 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  34.44 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.88 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  33.52 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.84 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.86 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.04 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  31.87 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1599  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.49 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0287607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12851  phosphatase  25.25 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.35108  normal  0.0690398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  28.65 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  23.96 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.49 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.68 
 
 		 260 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>