83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3200 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  100 
 
 		 233 aa  473  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  89.7 
 
 		 233 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  69.43 
 
 		 230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  62.45 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  55.75 
 
 		 243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.31 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  39.38 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  42.79 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.91 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.91 
 
 		 234 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.1 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  39.6 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  32.89 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  35.75 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.85 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  39.8 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.94 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.88 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  36.89 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  37.06 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.24 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  36.89 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.98 
 
 		 268 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  36.89 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  32.55 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.51 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.84 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.16 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.68 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.26 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.21 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.94 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  25.83 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.29 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  30.36 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  23.91 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  25.73 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2811  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.19 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  29.23 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  37.11 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.27 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  26.27 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.09 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  32.31 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.77 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  21.66 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  28.77 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.13 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  29.75 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  32.65 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  32.65 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  32.65 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  32.65 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  27.52 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.34 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  31.63 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  31.63 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  31.31 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  27.88 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  27.09 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  29.25 
 
 		 156 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.75 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.13 
 
 		 229 aa  42  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.75 
 
 		 231 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.77 
 
 		 234 aa  42  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.57 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>