64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1727 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 232 aa  476  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  61.43 
 
 		 235 aa  294  9e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  53.36 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  49.75 
 
 		 238 aa  224  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.46 
 
 		 248 aa  223  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  46.96 
 
 		 234 aa  221  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  45.05 
 
 		 256 aa  215  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  47.53 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.05 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.67 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  44.74 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.67 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  45.75 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  45.75 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  42.22 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  42.6 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  42.92 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.59 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.87 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.39 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.24 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.9 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.39 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  32.88 
 
 		 233 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.45 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  33.84 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.26 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  24.26 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  25.73 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  25.73 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  25.73 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.06 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  24.21 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  23.41 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  24.9 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.42 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  23.41 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.96 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  28.18 
 
 		 158 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  29.52 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.64 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.37 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.63 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.33 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.61 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  25.51 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.15 
 
 		 349 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  25.25 
 
 		 231 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.81 
 
 		 260 aa  42  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 235 aa  42  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>