52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3328 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  43.59 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  46.75 
 
 
231 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  42.31 
 
 
233 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  43.29 
 
 
230 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  40.73 
 
 
243 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.42 
 
 
234 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  37.31 
 
 
233 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.44 
 
 
234 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  35.96 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  35.96 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.47 
 
 
238 aa  144  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.25 
 
 
234 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  35.27 
 
 
237 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  35.32 
 
 
234 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  36.12 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  33.73 
 
 
256 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.85 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.97 
 
 
268 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  35.43 
 
 
231 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.53 
 
 
237 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  32.74 
 
 
238 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  34.8 
 
 
249 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.51 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  30.84 
 
 
229 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.45 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  30.77 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.41 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  29.01 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.35 
 
 
229 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  32.74 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
231 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.81 
 
 
233 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.55 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
219 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  22.61 
 
 
220 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.96 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  25.74 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  27.62 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  23.92 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  25.6 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.44 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  26.41 
 
 
232 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  26.61 
 
 
230 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  29.41 
 
 
225 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  26.44 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  32.48 
 
 
232 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>