66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1570 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  100 
 
 
230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  69.43 
 
 
233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  69.13 
 
 
233 aa  322  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  64.63 
 
 
231 aa  298  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  56.64 
 
 
243 aa  271  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.29 
 
 
250 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  41.07 
 
 
234 aa  151  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  38.46 
 
 
256 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  38.29 
 
 
233 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.43 
 
 
234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.94 
 
 
234 aa  125  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  37.88 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  35.71 
 
 
238 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  37.33 
 
 
231 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.56 
 
 
238 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.82 
 
 
248 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  34.98 
 
 
237 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  36.4 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.63 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.98 
 
 
268 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  36.4 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.63 
 
 
234 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  31.11 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.88 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.84 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.83 
 
 
237 aa  104  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  33.33 
 
 
235 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  30.54 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.82 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.97 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.37 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  28.81 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  31.91 
 
 
204 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  35.96 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  26.85 
 
 
158 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  27.73 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.42 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  27.35 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  28.39 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
242 aa  48.5  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  25.37 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.83 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  24.44 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  29.6 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  33.33 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
233 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  23.65 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  29.73 
 
 
156 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.62 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  25 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  25.12 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.66 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  26.09 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.85 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  25.69 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  28.15 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.15 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  28.04 
 
 
155 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  28.29 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  25.24 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>