48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0670 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  68.53 
 
 		 237 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  68.53 
 
 		 237 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  68.53 
 
 		 237 aa  316  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  64.94 
 
 		 234 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  64.07 
 
 		 234 aa  304  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  63.76 
 
 		 233 aa  301  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  65.65 
 
 		 234 aa  301  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  61.33 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  59.32 
 
 		 237 aa  275  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  53.04 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  49.12 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  50.67 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  50.99 
 
 		 256 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  46.02 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  40.72 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.68 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  41.13 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  42.25 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.16 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.16 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.39 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.29 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.25 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  37.79 
 
 		 243 aa  134  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  36.94 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  39.8 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  35.78 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  38.24 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  23.76 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.8 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.03 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  22.17 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  25.4 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  26.74 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  22.9 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  23.85 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.56 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  23.94 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  21.99 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.73 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  24.24 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.79 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.12 
 
 		 231 aa  42  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  26.81 
 
 		 230 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.19 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>