42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2305 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  48.21 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  45.45 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.92 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  43.42 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  44.54 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  43.35 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  43.53 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.16 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.98 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  43.17 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  43.17 
 
 		 237 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.9 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.97 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.65 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.41 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.06 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  42.11 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  43.78 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  38.91 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.36 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.32 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  36.11 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.97 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  34.76 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  34.98 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  35.96 
 
 		 233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  34.98 
 
 		 233 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  33.98 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  24.9 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.69 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.57 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  22.13 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  26.47 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.75 
 
 		 236 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 220 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.68 
 
 		 236 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0226  HAD family hydrolase  24.66 
 
 		 218 aa  42  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  4.68138e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>