118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4295 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  100 
 
 		 256 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  79.74 
 
 		 238 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  57.14 
 
 		 234 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  55.07 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.02 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  50.43 
 
 		 231 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.43 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  50.24 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  49.34 
 
 		 233 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.19 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.13 
 
 		 234 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  50 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  50 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.05 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  50.5 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.99 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  44.92 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  51.74 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  43.24 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.04 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  44.06 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.58 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.42 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  38.46 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.73 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  35.17 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  39.6 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  38.61 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  38.12 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.4 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.71 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.32 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.79 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  28.37 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  23.69 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  26.6 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  24.39 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  24.77 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  22.49 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  25 
 
 		 234 aa  52.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  28.57 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  27.44 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  21.37 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  28.03 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  22.6 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  26.29 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.4 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  23.98 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  24.78 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  25.12 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  25.12 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  24.69 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  25.12 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  24.66 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  27.41 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  22.62 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.44 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  28.16 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  22.62 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  25.71 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  24.3 
 
 		 224 aa  45.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  23.87 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.87 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  23.87 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  24.28 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  23.87 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  23.87 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  25.1 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  23.87 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.29 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.58 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  23.87 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  23.87 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  22.93 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  26.22 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  23.87 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.09 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  21.94 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  21.94 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  21.94 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  21.94 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  21.94 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.61 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.21 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  27.11 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.58 
 
 		 349 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>