189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3343 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  100 
 
 		 238 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.61 
 
 		 280 aa  218  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.79 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  48.07 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.96 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.37 
 
 		 248 aa  197  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.93 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.69 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  46.44 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.89 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  44.25 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  52.81 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  46.51 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  44.93 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  52.25 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.98 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.98 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.2 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.2 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  47.96 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.01 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.44 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.95 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  50.27 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  42.17 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.95 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.66 
 
 		 268 aa  178  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  46.12 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.56 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.19 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.56 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  44.39 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.05 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.66 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.06 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  43.06 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  44.27 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  43.65 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  40.28 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.33 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.26 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.9 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  39.38 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  37.43 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  38.34 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  36.26 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.23 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.43 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.9 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  37.5 
 
 		 334 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.68 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.5 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  36.7 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.7 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.32 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.23 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  36.7 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.17 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  36.07 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.39 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.7 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.7 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  36.17 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  36.17 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  36.17 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  36.17 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  36.17 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  36.17 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  35.79 
 
 		 267 aa  91.7  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  32.97 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  31.21 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  27.32 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  28.5 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  32.65 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  30.11 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  35.16 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.65 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  28.32 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  33.63 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  43.75 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  43.75 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.07 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  23.96 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  34.07 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1231  HAD family hydrolase  31.73 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.07 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  26.63 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  34.07 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  28.48 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  26.63 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  28.48 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0983  P-Ser-HPr phosphatase  23.78 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.97 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4107  HAD superfamily hydrolase  34.07 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  24.78 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>