83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4024 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
238 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  66.23 
 
 
234 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  65.79 
 
 
234 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  65.79 
 
 
233 aa  316  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  58.44 
 
 
237 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  60.17 
 
 
237 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  60.17 
 
 
237 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  61.33 
 
 
234 aa  279  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  57.39 
 
 
234 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  53.88 
 
 
237 aa  264  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  55.11 
 
 
231 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  48.25 
 
 
238 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  47.19 
 
 
256 aa  225  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  49.34 
 
 
234 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.05 
 
 
232 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  44.14 
 
 
229 aa  208  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  44.59 
 
 
249 aa  205  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  44.07 
 
 
245 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.87 
 
 
250 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.27 
 
 
237 aa  191  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.97 
 
 
248 aa  191  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  41.78 
 
 
235 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.06 
 
 
268 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.47 
 
 
250 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  38.38 
 
 
243 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  37.56 
 
 
230 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  35.94 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  37.32 
 
 
231 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  35.02 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.59 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  24.43 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  26.69 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  27.14 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.83 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  27.14 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  27.14 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.14 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  27.14 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  28.29 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.12 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  25.42 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  25.42 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  25.42 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  25.42 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  25.42 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  27.14 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  27.14 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  27 
 
 
225 aa  47  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  27.14 
 
 
225 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  30.07 
 
 
182 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.07 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  27.5 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  29.73 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  25.12 
 
 
238 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  22.45 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.08 
 
 
220 aa  45.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.59 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  29.41 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  28.35 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31.45 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  26.9 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  26.9 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  26.9 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  31.19 
 
 
158 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  29.01 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  30.22 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  27.84 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.91 
 
 
234 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  28 
 
 
176 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  24.88 
 
 
238 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  24.88 
 
 
238 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  24.88 
 
 
238 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  24.88 
 
 
238 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  32.8 
 
 
245 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
231 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
232 aa  41.6  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  27.84 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>