94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  56.64 
 
 		 230 aa  271  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  55.75 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  55.31 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  53.98 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.73 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.78 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.84 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.89 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  40.7 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.38 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  35.62 
 
 		 245 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.79 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  35.91 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  37.98 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  35.17 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  33.04 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.45 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  33.64 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  38.38 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  34.11 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.76 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.85 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  30.48 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.84 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.14 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  26.47 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.17 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.23 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  24.89 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  25 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  25 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  27.72 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  25 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.92 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  25.68 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.77 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  24.51 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  24.51 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  25.87 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  26.4 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.08 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  27.14 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  25.93 
 
 		 158 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.1 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  27.12 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  24.51 
 
 		 225 aa  45.4  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  26.01 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  26.79 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  25.76 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  26.26 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  26.32 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  32.58 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.58 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.5 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  26.63 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  26.63 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  30.65 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  24.47 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  23.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  23.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  23.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  23.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  26.26 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  23.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.86 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  22.56 
 
 		 300 aa  42  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>