91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2216 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  100 
 
 
245 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  60.68 
 
 
238 aa  263  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  55.07 
 
 
256 aa  260  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  51.75 
 
 
234 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.15 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  45.85 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  47.11 
 
 
233 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.53 
 
 
232 aa  209  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.45 
 
 
234 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.41 
 
 
237 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  46.22 
 
 
237 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.78 
 
 
234 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.02 
 
 
234 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.07 
 
 
238 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  44.84 
 
 
229 aa  201  8e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  47.83 
 
 
235 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.92 
 
 
234 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  46.43 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  46.43 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.48 
 
 
237 aa  195  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  42.16 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.65 
 
 
250 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.78 
 
 
268 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  35.62 
 
 
243 aa  134  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.12 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  37.88 
 
 
230 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  35.75 
 
 
233 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  34.39 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  35.27 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  27.27 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  31.19 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25.98 
 
 
231 aa  52.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.96 
 
 
233 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  26.17 
 
 
238 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.76 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
219 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  27.59 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  24.36 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  29.2 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  25.69 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.96 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  29 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  25.76 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.76 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  24.36 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  25.76 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  25.42 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  25.12 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  25.12 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  25.76 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  25.69 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.69 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  28.16 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  24.67 
 
 
234 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.17 
 
 
241 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  28.32 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  28.32 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  28.32 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  28.32 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  28.32 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  29.41 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  23.96 
 
 
249 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  29.41 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  23.81 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.08 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  23.81 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  24.24 
 
 
231 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.47 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  27.45 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  33.33 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  27.36 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  20.3 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  24.68 
 
 
231 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.84 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  23.61 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  21.53 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  29.25 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  25.52 
 
 
231 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.47 
 
 
225 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  24.27 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  30.09 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.2 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  24.64 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  26.27 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  22.13 
 
 
245 aa  42  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>