81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5807 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  76.29 
 
 		 234 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  77.19 
 
 		 234 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  65.79 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  61.8 
 
 		 237 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  63.76 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  61.37 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  61.37 
 
 		 237 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  58.19 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  54.94 
 
 		 237 aa  271  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  55.11 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  49.34 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  50.22 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  48.25 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  47.11 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  46.15 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  43.95 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.74 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.36 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  41.55 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.35 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.32 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.58 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.31 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  42.79 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  42.42 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  38.29 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  37.98 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  36.49 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  29.32 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.78 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.61 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  29.84 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  27.21 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.17 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  22.78 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31.36 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  27.73 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.58 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  28.05 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  26.28 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.06 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.03 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.7 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  25.35 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  35.11 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  26.42 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  25.25 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.4 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  28.15 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  28.15 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  29.89 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  28.15 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  31.03 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  23.44 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  30.11 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  23.44 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.44 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  32.38 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  30.11 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  30.11 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  30.11 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  23.44 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  25.78 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.13 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 234 aa  42.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  27.21 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  21.89 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  30.28 
 
 		 158 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  21.89 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  21.89 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  21.89 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  21.89 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>