131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3606 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  79.74 
 
 		 256 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  58.55 
 
 		 234 aa  279  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  60.68 
 
 		 245 aa  263  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.05 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.25 
 
 		 234 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.25 
 
 		 234 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  49.56 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.25 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  50.22 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  49.52 
 
 		 237 aa  225  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.75 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.12 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  47.55 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  53.54 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.3 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  54.04 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  54.04 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.37 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.45 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  45.59 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  43.56 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.64 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  35.91 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  35.71 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.74 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  38.61 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  37.06 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  35.07 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.29 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.82 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  25.71 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  25.22 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  26.55 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  26.56 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.56 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  23.87 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.27 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.98 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.54 
 
 		 349 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  34.06 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.28 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  25.47 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  25.94 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2340  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.63 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.1 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  24.11 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  24.11 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  24.55 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.37 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  23.11 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  24.03 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  25 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  31.07 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  31.07 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  31.07 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  31.07 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  31.07 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  31 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  24.05 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  26.98 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  25.93 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  25.93 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  25.93 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  26.46 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  23.36 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  23.94 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  22.31 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  23.85 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  33.98 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.83 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.23 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  26.01 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.42 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  25.76 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  25.91 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  26.35 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0513  HAD family hydrolase  27.38 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  22.6 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  25.35 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.01 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>