35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0347 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 250 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  65.45 
 
 		 249 aa  332  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  44.67 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.37 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  47.64 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  44.3 
 
 		 234 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.87 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  42.11 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  41.88 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  42.11 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  42.34 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.49 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.69 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.2 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.83 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.24 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  43.5 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  36.89 
 
 		 229 aa  172  5.999999999999999e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.44 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.29 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  42.65 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  35.98 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.21 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.41 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  31.82 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  30.81 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  31.16 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  29.29 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.23 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  21.4 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  22 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.39 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  24.2 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>