64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0543 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  90.3 
 
 		 237 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  90.3 
 
 		 237 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  68.53 
 
 		 234 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  61.8 
 
 		 233 aa  308  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  64.41 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  62.34 
 
 		 234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  62.17 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  58.97 
 
 		 234 aa  290  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  58.44 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  50.66 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  53.54 
 
 		 238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  50.22 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  51.74 
 
 		 256 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  46.22 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.13 
 
 		 237 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.18 
 
 		 248 aa  197  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.22 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  45.1 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  40.36 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.34 
 
 		 250 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  39.55 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.11 
 
 		 268 aa  167  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.27 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  33.64 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  34.98 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  36.59 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  36.89 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.29 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  26.47 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.7 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  22.6 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 221 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  22.57 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  23.18 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  23.18 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  26.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  26.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  25.52 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.23 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  28.83 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  28.83 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  25.52 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  26.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  27.27 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  25.52 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.47 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  26.13 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  25 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  21.91 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  25.63 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  25.52 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.34 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  22.8 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  22.8 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  22.8 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  22.8 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  22.8 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  22.32 
 
 		 225 aa  42  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  25.93 
 
 		 229 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.96 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>