60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1000 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  50.24 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  49.52 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  43.4 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  46.41 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  43.4 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  43.48 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.41 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  42.13 
 
 		 237 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  43.16 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  42.65 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.27 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  40.39 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.68 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  39.32 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.83 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.46 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.45 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.87 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.06 
 
 		 250 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.72 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  38.21 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.36 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  31.84 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  33.83 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  31.84 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  31.84 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  31.98 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.32 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.82 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  25.49 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.71 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  22.6 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.08 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  23.37 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.11 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  31.37 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  30.39 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  26.21 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  23.21 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  23.55 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  23.15 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  27.86 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  24.24 
 
 		 158 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.28 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  25.13 
 
 		 224 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  25.13 
 
 		 224 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  30.39 
 
 		 226 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  25.13 
 
 		 224 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.48 
 
 		 237 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  32 
 
 		 224 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>