181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1397 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  331  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  57.24 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  57.24 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  52.05 
 
 		 188 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 176 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  31.58 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  30.08 
 
 		 230 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.17 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.66 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.08 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  29.07 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.44 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.28 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 231 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.41 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  30.56 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.12 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  29.29 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  34.09 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  29.13 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  30.88 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.81 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.77 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.79 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.81 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 237 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  31.48 
 
 		 231 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  26.85 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  27.43 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  24.79 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  23.93 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  24.79 
 
 		 230 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 245 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.43 
 
 		 228 aa  51.6  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  23.44 
 
 		 231 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  23.44 
 
 		 231 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.28 
 
 		 219 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 230 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 248 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.62 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  23.62 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  32.1 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.72 
 
 		 234 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  31.17 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  43.48 
 
 		 247 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  37.7 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  22.83 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  23.62 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  29.82 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.62 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  30.16 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  25.24 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.79 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.57 
 
 		 245 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.27 
 
 		 240 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 239 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  22.83 
 
 		 231 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  27.78 
 
 		 233 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  38 
 
 		 258 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.35 
 
 		 234 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 249 aa  47.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 228 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  27.38 
 
 		 207 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.01 
 
 		 235 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  29.63 
 
 		 233 aa  47.4  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.87 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.57 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 259 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  28.04 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  25.23 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  36.17 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  25 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.98 
 
 		 248 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.4 
 
 		 260 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.53 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.03 
 
 		 234 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.18 
 
 		 232 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  25.71 
 
 		 256 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  22.4 
 
 		 228 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.62 
 
 		 236 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  28.92 
 
 		 229 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 		 263 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>