118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1615 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  51.74 
 
 		 158 aa  177  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  56.62 
 
 		 155 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  54.48 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  35.29 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  25.31 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  30.7 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  32.63 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  29.57 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 259 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 255 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  36.23 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  37.68 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  35.71 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.4 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  36.23 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  36.23 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.48 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.59 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  25.87 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  32.39 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  25.36 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06050  hypothetical protein  25.83 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.62 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  20.51 
 
 		 231 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  22.54 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  22.54 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  34.78 
 
 		 231 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  22.54 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  21.83 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  30.99 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  29.25 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.6 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.54 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  20.66 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.03 
 
 		 227 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.8 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  26.61 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  30.99 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 		 248 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  24.8 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.02 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  24.8 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  27.62 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.24 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  33.66 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.6 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.19 
 
 		 260 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  28.04 
 
 		 229 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.21 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24 
 
 		 254 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.18 
 
 		 263 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  25 
 
 		 245 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  44.19 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.72 
 
 		 259 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  26.17 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  27.33 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.99 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.77 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  33.96 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  24.22 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  24.22 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  26.17 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0513  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  24.29 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  28.32 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.36 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.02 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.06 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.39 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  19.55 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  25.87 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.32 
 
 		 244 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  33.8 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  25.5 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.51 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>