185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06050 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06050  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  460  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.32 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.33 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.65 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.7 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.87 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  25.88 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.71 
 
 		 583 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.34 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  25.24 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  25.24 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  35.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  35.42 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  35.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  35.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.97 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.61 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  35.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  35.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  35.42 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.61 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.93 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.92 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  25.35 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  25.35 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  36.46 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.76 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  21.53 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  32.41 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.88 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.12 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.6 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  33.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  33.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  33.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  33.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  33.67 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  24.87 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.71 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.71 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.71 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  28 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.71 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.71 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  37.5 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  22.22 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.26 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  25.83 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.11 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.87 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.92 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.07 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  25.4 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  24 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  23.92 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.31 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.07 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  22.17 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.63 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  26.62 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  24.86 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.26 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  32.18 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  35.48 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  35.48 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.48 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  29.75 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  37.63 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  27.83 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  23.78 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2416  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.15 
 
 		 266 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  36.62 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  23.78 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6497  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.55 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>