251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3065 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  100 
 
 		 182 aa  363  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  61.68 
 
 		 176 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  51.18 
 
 		 171 aa  165  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  91.7  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  32.31 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  33.08 
 
 		 155 aa  85.1  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.04 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  30.48 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31.34 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  28.68 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.19 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  31.51 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  28.65 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.63 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.2 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  29.11 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  40 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.04 
 
 		 238 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  20.61 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.33 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 264 aa  51.6  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  27.48 
 
 		 238 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  27.48 
 
 		 238 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  27.48 
 
 		 238 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  27.48 
 
 		 238 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.07 
 
 		 246 aa  51.2  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.43 
 
 		 241 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  27.73 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.83 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.9 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.05 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  24.44 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.62 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  36.96 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.9 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  20.25 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  23.53 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.7 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.46 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 258 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  25 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  22.33 
 
 		 229 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.7 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 260 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  36.08 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.59 
 
 		 222 aa  48.5  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.73 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  23.85 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  18.4 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.48 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.43 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  18.4 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.39 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.47 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  36.54 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.21 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  30 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  22.33 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  20.18 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  22.22 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  25.56 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0592  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38.82 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.866632 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  20.45 
 
 		 231 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  22.81 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.33 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  32.61 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0262  HAD family phosphatase  36.79 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  32.33 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.07 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  22.31 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  24.14 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.26 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  25.56 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1156  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  30.43 
 
 		 284 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  26.05 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  26.72 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  26.05 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>