52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1033 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  55.11 
 
 
238 aa  257  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  55.11 
 
 
233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.28 
 
 
234 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  56.56 
 
 
234 aa  249  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  53.71 
 
 
237 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.4 
 
 
234 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  53.71 
 
 
237 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.04 
 
 
234 aa  241  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  50.66 
 
 
237 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  49.56 
 
 
238 aa  231  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  50.43 
 
 
237 aa  231  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  52.47 
 
 
234 aa  229  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  50.43 
 
 
256 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  45.85 
 
 
245 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  45.7 
 
 
229 aa  209  4e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.16 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.6 
 
 
232 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.54 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  45.81 
 
 
249 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.45 
 
 
248 aa  185  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  38.91 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.28 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  37.33 
 
 
230 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  37.73 
 
 
231 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.43 
 
 
250 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  38.38 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  39.8 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  39.29 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.25 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.54 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.46 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.87 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  25.62 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  29.52 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  27.42 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  27.03 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  26.44 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  31.53 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  26 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.46 
 
 
349 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  25 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  25.36 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  32.03 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  26.32 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.26 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  25.64 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  25.53 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  23.81 
 
 
228 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  28.57 
 
 
224 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>