78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0495 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.34 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  46.5 
 
 		 363 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  44.16 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  47.76 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.81 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.81 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  39.41 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.32 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  29.74 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.12 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.06 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  27.22 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  29.23 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.81 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  30.98 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.86 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  32.97 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.8 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3398  phosphoglycolate phosphatase, putative  25.65 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000172911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  31.05 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.96 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.84 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  30.61 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  25.44 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  25.22 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  26.63 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  25 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.91 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  27.81 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  25.94 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.11 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.79 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  24.66 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  32.48 
 
 		 193 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  32.38 
 
 		 216 aa  42  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.17 
 
 		 215 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  27 
 
 		 227 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1502  HAD family phosphatase  26.32 
 
 		 166 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 216 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>