73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2332 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  43.35 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  39.7 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.56 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.41 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  36.08 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.93 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  39.41 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30.06 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  27.54 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  28.9 
 
 		 334 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  29.24 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  36.56 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  26.47 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.87 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  24.89 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  28.32 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.69 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.02 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.9 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.35 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.06 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.41 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 263 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  27.98 
 
 		 287 aa  45.1  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.71 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  21.31 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.9 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  22.93 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  26.44 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.42 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.9 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.39 
 
 		 618 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.06 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  24.56 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.06 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.06 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  27.84 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.84 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.57 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  25.67 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  27.64 
 
 		 215 aa  42  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.98 
 
 		 215 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  22.93 
 
 		 225 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  24.71 
 
 		 216 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 223 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.47 
 
 		 209 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  26.79 
 
 		 215 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  23.91 
 
 		 212 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.57 
 
 		 218 aa  42  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 		 228 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 231 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.85 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.23 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  29.94 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>