121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0181 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  100 
 
 		 322 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  77.54 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  56.68 
 
 		 281 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  57 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  58.16 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.37 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  57.28 
 
 		 263 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  57.28 
 
 		 263 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  56.59 
 
 		 267 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  56.52 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  53.4 
 
 		 267 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  56.31 
 
 		 263 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  55.34 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  56.31 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  56.59 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  56.59 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  56.59 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  56.59 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.34 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.56 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  56.31 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  56.31 
 
 		 263 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.31 
 
 		 233 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  50.53 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  47.89 
 
 		 212 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.12 
 
 		 216 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  39.6 
 
 		 241 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  42.47 
 
 		 215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.04 
 
 		 248 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  36.96 
 
 		 214 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  37.63 
 
 		 237 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  39.67 
 
 		 215 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  38.97 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.13 
 
 		 215 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.59 
 
 		 215 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.14 
 
 		 243 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.11 
 
 		 228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  35.68 
 
 		 229 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.95 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.59 
 
 		 248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.59 
 
 		 248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.72 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  33.15 
 
 		 213 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.46 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.83 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.5 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  31.82 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  31 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.95 
 
 		 233 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  34.05 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.31 
 
 		 243 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  33.33 
 
 		 237 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  32.8 
 
 		 234 aa  99.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  32.8 
 
 		 234 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.98 
 
 		 235 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 220 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  34.05 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.49 
 
 		 237 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  34.05 
 
 		 235 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  32.61 
 
 		 231 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.72 
 
 		 232 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.16 
 
 		 222 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  34.59 
 
 		 250 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 		 234 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.33 
 
 		 220 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.05 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.52 
 
 		 217 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.27 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.13 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.17 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  30.06 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  30.98 
 
 		 212 aa  52.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2829  hypothetical protein  35.05 
 
 		 265 aa  52.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  24.62 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  25.96 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  32 
 
 		 220 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.2 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  22.39 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 		 229 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  28.16 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  21.39 
 
 		 223 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  30.51 
 
 		 240 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.35 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  31.2 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>