135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2827 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  57.92 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  56.94 
 
 		 229 aa  238  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.45 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  48.97 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.42 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.54 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  41.67 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.06 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  43.6 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  49.16 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  42.66 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  43.72 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.99 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  45.7 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  42.2 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  41.86 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.6 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  45.81 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.45 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.93 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.66 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  40.18 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.54 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  41.28 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.51 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  43.06 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.42 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.93 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.3 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.2 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.2 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.64 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  38.1 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.63 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.99 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.27 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.96 
 
 		 268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  39.11 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.65 
 
 		 220 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.78 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  43.01 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  38.25 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.47 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.42 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.15 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  37.63 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  34.11 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  36.55 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  36.56 
 
 		 334 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.22 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.22 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.69 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.47 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  35.47 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.47 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  35.47 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.47 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.47 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.87 
 
 		 252 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.61 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  34.48 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  35.15 
 
 		 267 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  32.16 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  34.39 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  31.72 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  26.73 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  30.34 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  28.65 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  31.33 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  27.37 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.65 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  29.14 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.68 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  32.14 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4176  HAD family hydrolase  25 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.75 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  26.29 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  28.35 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.71 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  35.53 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  28.27 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 		 298 aa  45.1  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>