98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2794 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  89.05 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  51.5 
 
 		 363 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  51.26 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  49.75 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.41 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  44.81 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  36.41 
 
 		 215 aa  141  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.74 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  27.66 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  28.89 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.46 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.46 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.05 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.73 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.47 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  29.03 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  24.06 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  28.42 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  24.19 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  25.67 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.94 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25 
 
 		 230 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.91 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.88 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.6 
 
 		 249 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  27.49 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  24.23 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  25.27 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  28.72 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.86 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  32.47 
 
 		 259 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  24.74 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  27.01 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  28.35 
 
 		 250 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  27.92 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 220 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.78 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  23.59 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.11 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  27.46 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  29.49 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  26.67 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  24.28 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  28.46 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  24.28 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.06 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.84 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.33 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.02 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  27.14 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.18 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.37 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  29.36 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.62 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  28.26 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  28.26 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.64 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.17 
 
 		 260 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  32.5 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 233 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  32.18 
 
 		 251 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  25.82 
 
 		 215 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  22.61 
 
 		 229 aa  42  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.41 
 
 		 254 aa  42  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  29.36 
 
 		 230 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.87 
 
 		 243 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 243 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 231 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 243 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  30.86 
 
 		 221 aa  42  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 243 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.26 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.83 
 
 		 243 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.82 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.47 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  25.7 
 
 		 240 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  23.87 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.63 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.27 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>