84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2296 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  94.12 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  94.12 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  81.51 
 
 		 249 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  78.66 
 
 		 243 aa  384  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  78.33 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  60.44 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  55.7 
 
 		 231 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  56.11 
 
 		 238 aa  247  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  54.3 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.41 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  53.98 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.46 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  52.91 
 
 		 236 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.59 
 
 		 249 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.09 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.57 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  52.21 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.56 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  53.18 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  51.77 
 
 		 234 aa  228  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.93 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.12 
 
 		 232 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  48.92 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.1 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  44.89 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  44.84 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.55 
 
 		 215 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.83 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  42.53 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.06 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.41 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  42.15 
 
 		 214 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  42.86 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.4 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  40.45 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  38.39 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.55 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  36 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.09 
 
 		 221 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.02 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.29 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  35.14 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.82 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  36.87 
 
 		 334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  33.51 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  32.8 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30.94 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.69 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.69 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.3 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.41 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  30.41 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.22 
 
 		 267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.9 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.16 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  30.16 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  31.92 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  30.27 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.31 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.38 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.38 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.23 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  26.87 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  27.27 
 
 		 190 aa  57  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.05 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  27.93 
 
 		 188 aa  49.3  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 363 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.24 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  25.37 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  24.75 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  26.06 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  34.48 
 
 		 142 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>