142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0010 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 
221 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.5 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  42.58 
 
 
220 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.98 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  40.78 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  40 
 
 
233 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  41.9 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  41.9 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  37.7 
 
 
234 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.66 
 
 
280 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  40 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  38.92 
 
 
235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  38.38 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.69 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  37.17 
 
 
234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.46 
 
 
233 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  37.84 
 
 
231 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.17 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  37.3 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  39.46 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  33.49 
 
 
212 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.46 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.22 
 
 
215 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.09 
 
 
243 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.92 
 
 
215 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.44 
 
 
222 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.26 
 
 
248 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.06 
 
 
243 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  39.46 
 
 
250 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.97 
 
 
214 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.92 
 
 
268 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.65 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.78 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.5 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.65 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.46 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.87 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  33.82 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  35.83 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.02 
 
 
237 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.02 
 
 
235 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.17 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.89 
 
 
228 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  36.46 
 
 
214 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  35.36 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.08 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.32 
 
 
233 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  34.24 
 
 
243 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  33.7 
 
 
263 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.7 
 
 
263 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.15 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  33.15 
 
 
263 aa  94.7  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.07 
 
 
252 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.1 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.61 
 
 
263 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  30.43 
 
 
287 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.61 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.15 
 
 
263 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  30.43 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.06 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.89 
 
 
285 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  30.98 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  30.98 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  30.98 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  30.98 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  30.98 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  30.98 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30.27 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  28.34 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  30.1 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  30.81 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  28.76 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  27.37 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  27.72 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  26.2 
 
 
202 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  28.04 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.55 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.1 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  27.07 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  28 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  36.73 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  25.64 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.5 
 
 
197 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  27.83 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.36 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1451  HAD superfamily hydrolase  27.6 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  34.12 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  36.76 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.97 
 
 
194 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>