64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42723 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.56 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.2 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.83 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  28.36 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.67 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  26.8 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  26.34 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.6 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  41.77 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  24.38 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.35 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.25 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.88 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  27.84 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.37 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  26.32 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  25.13 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.87 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.87 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.38 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.32 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  25.94 
 
 		 243 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  23.71 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.63 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.62 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  24.87 
 
 		 322 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.63 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  26.24 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.09 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3605  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  26.29 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 267 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  24.48 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.09 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  24.08 
 
 		 229 aa  44.7  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  26.42 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.52 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.62 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.59 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  22.34 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 396 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  21.03 
 
 		 287 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1676  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.4 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  27.06 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.74 
 
 		 240 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 214 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  32.94 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.2 
 
 		 280 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  20.83 
 
 		 263 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  20.83 
 
 		 263 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  25 
 
 		 213 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.13 
 
 		 267 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  22.16 
 
 		 248 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.96 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  21.94 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  25.51 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  31.33 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.89 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>