104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3943 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 228 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  59.07 
 
 		 215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  58.14 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  57.67 
 
 		 215 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  57.34 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  53.21 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  52.56 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.44 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.93 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  45 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.17 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  43.3 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.95 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  42.99 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  42.6 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  43.75 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  42.6 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.53 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  43.3 
 
 		 236 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.52 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  41.48 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  45.05 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.52 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  42.6 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  40.71 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.41 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.13 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.91 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  40.18 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.62 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  45.41 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.55 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.55 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.55 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.38 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.05 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.18 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.24 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.83 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  39.79 
 
 		 212 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  41.27 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  37.91 
 
 		 241 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.49 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  34.82 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.54 
 
 		 285 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.06 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  37.11 
 
 		 322 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  40 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.89 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.27 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  38.64 
 
 		 334 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  33.48 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  35.33 
 
 		 267 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  35.14 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  35.14 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  35.14 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  35.14 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  35.14 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  35.14 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.17 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  34.25 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.25 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.33 
 
 		 267 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.05 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.24 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.41 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.87 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.41 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  33.7 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  28.57 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  33.06 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  28.42 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  37.16 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  23.44 
 
 		 287 aa  49.3  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  37.68 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.8 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.71 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  26.6 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.75 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  34.78 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  34.78 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  34.78 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.62 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  34.78 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  34.78 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>