92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0867 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  90.12 
 
 		 243 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  78.66 
 
 		 243 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  79.32 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  79.32 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  76.99 
 
 		 249 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  59.48 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  58.08 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  56.39 
 
 		 231 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  55.86 
 
 		 238 aa  248  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  54.63 
 
 		 237 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.95 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  53.74 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  51.97 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  51.53 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  51.98 
 
 		 236 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  53.51 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  50 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.7 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.85 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.3 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.65 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  49.15 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.12 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.88 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  46.93 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  46.64 
 
 		 215 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.13 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.86 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  43.32 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.36 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  42.08 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.66 
 
 		 215 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  39.82 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  42.2 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.38 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.09 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  37.27 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  36.27 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.63 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.06 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  32.54 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.75 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  33.47 
 
 		 334 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.89 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  33.5 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  32.8 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.5 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.16 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  29 
 
 		 212 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.5 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.75 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.58 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.32 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  32.32 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.98 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.45 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  32.47 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  35.82 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  36.09 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  36.09 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  35.82 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  36.09 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  36.09 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.58 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.09 
 
 		 214 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.58 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  29.19 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  31.07 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  30 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  31.45 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  35.24 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  24.39 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  25.5 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  29.28 
 
 		 188 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  24.57 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.37 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 363 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25.56 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.32 
 
 		 254 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.929591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>