86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0063 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  79.92 
 
 		 267 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  79.1 
 
 		 267 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  78.7 
 
 		 263 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  78.7 
 
 		 263 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  80 
 
 		 263 aa  361  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  77.39 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  77.39 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  75.74 
 
 		 267 aa  348  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  80 
 
 		 263 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  79.13 
 
 		 263 aa  339  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  75.53 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  75.85 
 
 		 267 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  77.29 
 
 		 267 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  77.29 
 
 		 267 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  77.29 
 
 		 267 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  77.29 
 
 		 267 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.81 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  49.8 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.6 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  55.56 
 
 		 322 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  54.4 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.21 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  46.46 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.05 
 
 		 216 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  41.4 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  39.82 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  36.76 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.92 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.14 
 
 		 280 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.71 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  37.3 
 
 		 215 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  33.16 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  37.3 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.76 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  34.05 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  35.41 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  34.05 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  35.05 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.82 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  33.51 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  35.87 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  33.88 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.71 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.36 
 
 		 237 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  30.87 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.07 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.89 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.95 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  32.46 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.09 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.11 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.67 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.89 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 		 228 aa  89  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.37 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.77 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.5 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  31.35 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.69 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.09 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.09 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  31.89 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.31 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  31.35 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  32.86 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  26.87 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  27.31 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  26.6 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  25.91 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  23.76 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  31.01 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  24.26 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  25.38 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.26 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  27.46 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 227 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.88 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 		 226 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>