77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0942 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  56.87 
 
 		 212 aa  240  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  53.2 
 
 		 363 aa  226  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.25 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.76 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  44.39 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.58 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  36.1 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.93 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.7 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3160  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0720917  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  26.11 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3210  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.742759  normal  0.278604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3148  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0274068  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  25.82 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.8 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  24 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.06 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  25.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  25.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  24.18 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  24.18 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  24.18 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  25 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  26.52 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.35 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  24.27 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  27.93 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.93 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  25.64 
 
 		 253 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  27.37 
 
 		 322 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.26 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  26.84 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1502  HAD family phosphatase  26.23 
 
 		 166 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.43 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.86 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  25.95 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  23.44 
 
 		 266 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  22.92 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.05 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.06 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  28.12 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  22.92 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.21 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.43 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  22.87 
 
 		 296 aa  42.4  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  23.62 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  22.73 
 
 		 223 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  25.65 
 
 		 231 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.24 
 
 		 204 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.26 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 221 aa  42  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.22 
 
 		 248 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  29.17 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25.52 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>