226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3961 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  57.43 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.2 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  29.15 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  28.57 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3477  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.5 
 
 		 133 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 200 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.38 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.34 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.18 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  33.63 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  40.22 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  28.99 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.64 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.87 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  34.19 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  37.04 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  28.5 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1958  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.02 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.118058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.74 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  38.57 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  38.68 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  30.09 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.86 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  28.24 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  27 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  41.33 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  44.58 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.81 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  33.91 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.52 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.22 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  33.98 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  30.09 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  37.21 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  24.77 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.56 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  50.72 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  32.69 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  31.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.85 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.38 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.19 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  36.54 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3587  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.93 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  40.66 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  27.22 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  39.81 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  28.67 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  29.14 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.09 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  26.58 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  26.58 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  38.95 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.31 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.04 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  37.88 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 378 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.96 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 199 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.95 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  37.04 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  32.91 
 
 		 163 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  31.73 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.64 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.65 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.94 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.11 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  32.95 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.5 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  32.38 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>